تصريف الشؤون

يمكن أن ينشئ مؤتمر الأطراف هيئات فرعية معينة عند اللزوم تحقيقاً لغايات الاتفاقية. ومن أمثلة ذلك هيئة التفاوض الحكومية الدولية المعنية بوضع بروتوكول بشأن الاتجار غير المشروع بمنتجات التبغ، وهو أول بروتوكول محتمل لاتفاقية المنظمة الإطارية. كما أنشأ مؤتمر الأطراف العديد من الأفرقة العاملة المكلفة بوضع المبادئ التوجيهية والتوصيات من أجل تنفيذ مختلف أحكام المعاهدة.

تعمل أمانة الاتفاقية داخل منظمة الصحة العالمية بجنيف، وتقدم الدعم للأطراف من أجل الوفاء بالتزاماتها بموجب الاتفاقية وتمد الأمانة مؤتمر الأطراف وهيئاته الفرعية بالدعم اللازم وتترجم قرارات المؤتمر إلى أنشطة برمجية.